Pipeline LiDAR: accélération GPU (CuPy), sortie WebP, script run.sh

- Accélération GPU via CuPy pour SVF, Openness, LRM, MSRM, SAILORE, TPI, wavelet
- Fallback automatique vers numpy si GPU non disponible
- Sortie WebP sans perte (remplace PNG, fichiers plus petits)
- Script run.sh avec options -g (GPU), -w (workers), -r (résolution)
- Docker basé sur nvidia/cuda:12.4.0-devel pour support CuPy
- Docker tourne en uid/gid 1000:1000
- Légendes explicites différenciant LRM vs MSRM vs SAILORE
- Correction bug ordre elif (mslrm avant lrm)
- Retrait de geomorphons et VAT (demande utilisateur)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>

run.sh

@@ -0,0 +1,72 @@
+#!/bin/bash
+# Pipeline LiDAR Archéologique
+# Utilisation: ./run.sh [options]
+# Options:
+#   -r RESOLUTION   Résolution en m/px (défaut: 0.5)
+#   -w WORKERS      Nombre de workers parallèles (défaut: 1)
+#   -g              Activer l'accélération GPU
+#   -h              Afficher l'aide
+
+set -e
+
+SCRIPT_DIR="$(cd "$(dirname "$0")" && pwd)"
+INPUT_DIR="${SCRIPT_DIR}/input"
+OUTPUT_DIR="${SCRIPT_DIR}/output"
+IMAGE_NAME="lidar-lidar"
+RESOLUTION=0.5
+WORKERS=1
+GPU_FLAG=""
+
+while getopts "r:w:gh" opt; do
+    case $opt in
+        r) RESOLUTION="$OPTARG" ;;
+        w) WORKERS="$OPTARG" ;;
+        g) GPU_FLAG="--gpus all" ;;
+        h)
+            echo "Pipeline LiDAR Archéologique"
+            echo ""
+            echo "Usage: $0 [-r RESOLUTION] [-w WORKERS] [-g]"
+            echo ""
+            echo "  -r RESOLUTION   Résolution en m/px (défaut: 0.5)"
+            echo "  -w WORKERS      Nombre de workers CPU parallèles (défaut: 1)"
+            echo "  -g              Activer l'accélération GPU NVIDIA"
+            echo "  -h              Afficher cette aide"
+            echo ""
+            echo "Exemples:"
+            echo "  $0                          # Traitement standard"
+            echo "  $0 -g                       # Avec accélération GPU"
+            echo "  $0 -g -w 4                  # GPU + 4 workers parallèles"
+            echo "  $0 -r 0.2 -g                # Haute résolution + GPU"
+            exit 0
+            ;;
+        *) echo "Option invalide. Utilisez -h pour l'aide." >&2; exit 1 ;;
+    esac
+done
+
+# Build l'image si elle n'existe pas
+if ! docker image inspect "$IMAGE_NAME" >/dev/null 2>&1; then
+    echo "Build de l'image Docker..."
+    docker build -t "$IMAGE_NAME" "$SCRIPT_DIR"
+fi
+
+# Créer les répertoires s'ils n'existent pas
+mkdir -p "$INPUT_DIR" "$OUTPUT_DIR"
+
+# Lancer le pipeline
+echo "============================================"
+echo " Pipeline LiDAR Archéologique"
+echo "============================================"
+echo "  Résolution : ${RESOLUTION}m/px"
+echo "  Workers    : ${WORKERS}"
+echo "  GPU        : $([ -n "$GPU_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')"
+echo "============================================"
+
+docker run --rm $GPU_FLAG \
+    --user 1000:1000 \
+    -v "${INPUT_DIR}:/data/input:ro" \
+    -v "${OUTPUT_DIR}:/data/output" \
+    "$IMAGE_NAME" \
+    python3 /usr/local/bin/process_lidar.py /data/input \
+    -o /data/output \
+    -r "$RESOLUTION" \
+    -w "$WORKERS"