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5af53a390f Add multi-GPU support and fix scale bar / location map overlap
Multi-GPU:
- gpu.py: lazy CuPy initialization so CUDA_VISIBLE_DEVICES takes
  effect before context creation in worker processes
- gpu.py: detect GPU count via nvidia-smi (no CUDA import needed)
- gpu.py: add set_active_gpu() to assign workers to specific GPUs
- pipeline.py: distribute files across GPUs (file % num_gpus) in
  parallel mode so both GPUs are used simultaneously
- pipeline.py: log GPU count when multiple GPUs detected

Layout fixes:
- rendering.py: move scale bar left of location map to avoid overlap
  (scale bar ends at fig_x=0.78, map starts at 0.82)
- rendering.py: expand location map inset to 0.16x0.13 fig coords
- rendering.py: return bounds from _download_location_map so imshow
  extent matches the actual IGN tile coverage (80km context)
- ign.py: add min_zoom parameter to download_ign_tiles, fixing the
  location map that was broken (zoom 10 blocked by hardcoded min_zoom=15)
2026-05-15 12:00:34 +02:00
4848f25326 Upgrade colormaps to Crameri scientific palette and fix IGN location map
- Replace RdBu_r with Crameri roma for all 6 relief-family colormaps
  (curvature, mslrm, lrm, tpi, sailore, aniso_open): perceptually
  uniform, CVD-friendly, dark center makes near-zero values visible
- Replace hsv with twilight for aspect: perceptually uniform cyclic
  colormap with no hue discontinuity
- Add cmcrameri dependency (falls back to RdBu_r if unavailable)
- Fix IGN location map: pass min_zoom=8 to download_ign_tiles so zoom
  10 context maps work (was hardcoded to min_zoom=15, blocking the
  loop entirely for zoom_level=10)
- Expand location map context from 3x extent to 80km fixed radius for
  better regional context at zoom 10
- Remove dead code: flow colormap entry, _nice_scale dead loop,
  aspect='auto' in location map imshow, outdated PDF report order list
- Fix SVF docstring: 8 directions → 16 directions
2026-05-15 11:50:15 +02:00
c634db573a Fix corrupted COPC detection, add CSF→SMRF fallback, improve MSRM colormap, add SVF and anisotropic openness
- validate_laz: verify point data accessibility (not just headers) to detect
  corrupted COPC files that pass header checks but fail on data reads
- classify_ground: fallback from CSF to SMRF when CSF produces no ground
  points or PDAL errors (fixes 2/9 failing tiles)
- MSRM: preserve sign in weighted combination so RdBu_r colormap shows
  both red (elevated) and blue (depressed) instead of red only
- Add Sky-View Factor (SVF) visualization: cos²(horizon angle) over 16
  directions, excellent for archaeological earthwork detection
- Add Anisotropic Openness: directional weighting (NW-SE/NE-SW) enhances
  linear feature detection aligned with common settlement patterns
- Remove anomalies and flow visualizations (replaced by SVF + aniso_open)
- Location inset: use IGN topographic map at zoom 10 instead of simplified
  France outline, with red rectangle marker and fallback
- Remove flow (hydrological accumulation) from VIZ_STEPS
2026-05-15 01:38:09 +02:00
da454bd23e Improve visualizations: adaptive scales, revert z-score to std normalization
- MSRM/TPI/roughness/anomalies: revert z-score (x-mean)/std to std normalization x/std
  to preserve contrast and visibility of linear features (paths, ditches, trenches)
- MSRM: adaptive scales based on resolution, archaeological weight combination
- TPI: extend from 2 to 4 scales (3m/15m/50m/200m) with weighted combination
- Hillshade: 8 directions instead of 4, altitude 35° instead of 30°
- LRM: adaptive sigma based on resolution
- Openness: doubled radius (100m instead of 50m)
- Roughness: multi-scale (3m fine + 15m broad) instead of single 5x5 window
- Anomalies: uses MSRM multi-scale relief instead of single LRM 15m
- Wavelet: 8 adaptive scales, std normalization, archaeological weights
- Remove svf (Sky-View Factor) and local_dominance visualizations
- Add AVIF format support (default), quality 98
- Add multi-resolution support (-r 0.5,0.2)
- Improve Ctrl+C handling for immediate process termination
- Update rendering.py descriptions for all modified visualizations
2026-05-14 23:12:08 +02:00
6aef7b8af3 Add WebP quality control and selective visualization (--only / --skip)
- WebP output now uses quality=85 by default (down from lossless),
  reducing file size by ~75% (35MB → 5-8MB per visualization)
- Added --quality N (1-100) and --lossless flags in CLI and run.sh
- Added --only and --skip to select/exclude specific visualizations
  (e.g., --only hillshade,svf,lrm or --skip ortho,topo)
- VIZ_STEPS filtering is done in LidarArchaeoPipeline.__init__
- SharedDEM is skipped when all selected visualizations already exist
- Invalid visualization names are validated at startup with clear error
2026-05-14 21:15:21 +02:00
f97e41eaea Remove RRIM and Multi-Hillshade RGB, fix DTM resolution reuse bug, add --init to docker run
- Remove generate_rrim, generate_multi_hillshade, _compute_openness_both
- Remove corresponding VIZ_STEPS entries, COLORMAPS, RGB_LEGENDS, and tests
- Fix DTM resolution mismatch: existing DTM at different resolution is now
  regenerated instead of silently reused
- Propagate actual DTM resolution to visualizations and rendering
- Add --init to docker run commands for proper signal handling on Ctrl+C
- Add .playwright-mcp/ to .gitignore
2026-05-14 02:19:42 +02:00
989bb71497 Add RRIM, Multi-Hillshade RGB, and Local Dominance visualizations
Three new visualizations complementing existing SVF/openness/LRM/MSRM:

- RRIM (Red Relief Image Map): RGB composite combining positive openness
  (R), inverted slope (G), negative openness (B). Uses ray-tracing
  to compute both openness values in a single pass.

- Multi-Hillshade RGB: 3 azimuths (315°, 135°, 45°) mapped to R/G/B
  channels with slope blending. Color reveals structure orientation.

- Local Dominance: (dem - local_min) / (local_max - local_min) using
  min/max filters. Measures local height position — complements openness.

Also adds:
- _compute_openness_both() helper for shared ray-tracing (used by RRIM)
- xp_maximum_filter() in gpu.py (GPU/CPU abstraction)
- Entries in COLORMAPS, RGB_LEGENDS, VIZ_STEPS, and is_rgb detection
- All NaN handling follows existing patterns (nan_mask restoration)
2026-05-14 01:03:47 +02:00
15cd77456d Fix bugs and improve pipeline flexibility
- Fix gpu_cleanup import missing in visualizations.py (NameError in workers)
- Fix t_pdf referenced before assignment when PDF is skipped
- Skip classification+DTM when DTM exists regardless of --force
- --force now only regenerates WebP/PDF, not classification/DTM
- --force-classification forces reclassification when needed
- Add laspy repair fallback for corrupt LAZ files (EVLR errors)
- Keep DTM TIF by default for reuse (--no-keep-tif to delete)
- Increase space between image and bottom cartouche (0.12→0.19)
2026-05-14 00:08:25 +02:00
a1a5078e8b Skip ground classification when DTM already exists
If the DTM .tif exists and --force is not set, skip both ground
classification and DTM generation entirely. Previously, the pipeline
would spend 3+ minutes reclassifying ground even when the DTM was
already present and would be reused anyway.

Also includes: SharedDEM cache, enhanced WebP cartouche (compass rose,
adaptive scale bar, enriched info bar), removed COG/viewer, UTF-8
fix for parallel workers, skip logic for DTM and PDF.
2026-05-13 23:41:21 +02:00
a37b8848ab Interface web cartographique: COG + TiTiler + viewer MapLibre
- Ajout de convert_to_cog() et generate_cog_metadata() dans rendering.py
- Nouveau module viewer.py: génération HTML MapLibre GL JS avec couches et opacité
- Nouveau module server.py: serveur FastAPI avec TiTiler pour tuiles COG
- Pipeline: étapes 5 (COGs) et 6 (viewer web) après le rapport PDF
- CLI: flag --no-viewer pour désactiver la génération du viewer
- run.sh: commande 'serve' pour démarrer le serveur sur port 8000
- Dockerfile: ajout de rio-cogeo, titiler.core, fastapi, uvicorn, piexif
- setup.py: point d'entrée lidar-server
2026-05-10 17:15:37 +02:00
5c155e4999 Layout uniforme WebP: axes fixes + aspect='equal' pour superposition géolocalisée
- Positions d'axes fixes (data_left/bottom/width/height_frac) pour alignement
  pixel-parfait entre terrain et ortho/topo
- aspect='equal' au lieu de 'auto' pour conserver les proportions géographiques
- Colorbar descriptive pour les visualisations RGB (ortho/topo)
- Comblage des petits trous DTM (< 1m) via rasterio.fill.fillnodata
- Suppression de la visualisation "dépressions"
- Hillshade composite: 0.7*hillshade + 0.3*cos(slope)
- D8 flow accumulation accéléré par numba JIT (fallback Python)
- Flag --keep-tif pour conserver les TIFF intermédiaires
- --force supprime aussi les TIF existants avant régénération
- ETA affiché pendant la génération des visualisations
- Répertoires temp dans temp/ pour traitement parallèle
2026-05-10 14:46:31 +02:00
a88e430f02 Audit: corrections de bugs identifiés
- rendering.py: colorbar cassée quand NaN mask actif — créer un
  ScalarMappable avec le cmap sauvegardé au lieu de rely sur
  l'image RGBA qui n'a plus de cmap
- rendering.py: nettoyage du PNG temporaire avec try/finally et
  missing_ok=True pour éviter les fichiers orphelins
- gpu.py: to_gpu() convertit en float32 au lieu de float64 pour
  réduire la consommation mémoire GPU
- dtm.py: utiliser _file_basename() de pipeline.py au lieu de
  dupliquer la logique d'extraction du basename
- pipeline.py: docstring corrigé (18 visualisations, pas 19)
- cli.py: --file supporte aussi les noms sans .copc
  (recherche .copc.laz et .copc.las en plus de .laz et .las)
2026-05-10 12:11:13 +02:00
e73cf75060 Rendu: zones NaN transparentes au lieu d'interpolation DTM
L'interpolation fillnodata du DTM générait des artefacts visuels
(zones lissées artificielles). Revenu au DTM avec NaN conservés.

Nouvelle approche pour le rendu:
- NaN remplacés par la médiane des valeurs valides (valeur neutre)
- Après application de la colormap, un masque alpha rend les zones
  NaN transparentes au lieu de les afficher
- interpolation='bilinear' sur imshow pour un rendu lisse
- Figure adaptative: 20-40 pouces selon la taille des données
- DPI 200 pour les images > 3000px
2026-05-10 11:56:11 +02:00
62038b2d5b Fix crash quand valid_data est vide dans _apply_colormap
np.percentile crash avec IndexError quand valid_data est vide
(TIF entièrement NaN). Ajout d'un guard qui retourne une
colormap par défaut si aucune donnée valide n'existe.
2026-05-10 11:42:21 +02:00
c5e9a60fee Amélioration du rendu: interpolation DTM et affichage haute résolution
- DTM: interpolation des NaN avec rasterio.fill.fillnodata après
  binned_statistic_2d — comble les trous entre les cellules sans données
- Rendering: interpolation='bilinear' sur imshow pour lisser le
  sous-échantillonnage des données haute résolution
- Rendering: fig_width adaptatif (20-40 pouces) selon la taille des données
- Rendering: DPI 200 pour les images > 3000px de large
2026-05-10 11:34:41 +02:00
ba6fb64754 Suppression de la visualisation Texture GLCM
- Suppression de generate_texture() de visualizations.py
- Suppression de l'entrée 'texture' de VIZ_STEPS et COLORMAPS
- Suppression du test TestTexture
- Mise à jour README (19 → 18 visualisations)
- Mise à jour AGENTS.md (17 → 16 fonctions generate_*)
2026-05-10 03:30:07 +02:00
67151c6409 Fix numpy warnings: MaskedArray partition et Mean of empty slice
- Convert MaskedArray to ndarray avant np.percentile() via
  np.asarray(data.compressed()) et np.ma.filled(data, np.nan)
- Supprimer RuntimeWarning "Mean of empty slice" dans MSRM et
  ondelette avec warnings.catch_warnings()
- Ajout import warnings dans visualizations.py
2026-05-10 03:02:36 +02:00
67380d0424 Pipeline LiDAR: classification sol auto + pré-traitement ELM + fix warnings
- Ajout classification automatique du sol (SMRF/PMF/CSF) avec détection
  heuristique (ratio retours uniques > 0.6 → PMF urbain, sinon SMRF)
- Pré-traitement PDAL recommandé avant classification: ELM + outlier
  removal (cell=5.0, threshold=2.0 adapté au calcaire rocailleux)
- Options CLI: --ground-classification {auto,smrf,pmf,csf} et
  --force-classification pour forcer la reclassification
- Fix double logging (logger.propagate = False)
- Fix --force non transmis dans run.sh (réécriture parsing arguments)
- Fix warning numpy 'partition will ignore mask': conversion MaskedArray
  en ndarray avant np.percentile()
- Ajout liblaszip8 + lazrs pour support LAZ dans Docker et laspy
- Tests unitaires pour PMF, CSF et auto-détection
2026-05-10 03:00:33 +02:00
c6d0065eca Fix PDF report: lire WebP via PIL au lieu de matplotlib.imread
matplotlib ne supporte pas WebP. Remplace plt.imread() par
PILImage.open().convert('RGB') dans generate_pdf_report.
2026-05-10 01:06:21 +02:00
e734c9c472 Suppression éclairage solaire, GPU accéléré, --file multi, tests unitaires
- Suppression de generate_solar (éclairage solaire) des visualisations
- Accélération GPU de hillshade, slope, aspect, curvature, depressions,
  anomalies, roughness, texture GLCM, flow (sink filling)
- Nettoyage mémoire GPU entre visualisations (gpu_cleanup)
- Correction OOM texture GLCM: calcul entropie bin par bin au lieu d'un
  tableau 3D massif sur GPU
- Correction bug: xp_minimum_filter manquant dans imports visualizations
- Option --file accepte plusieurs noms complets sans extension
- run.sh affiche l'aide si appelé sans arguments
- Option --test pour exécuter les tests unitaires dans Docker
- Filtre ReturnNumber>=1 intégré dans le pipeline PDAL (plus d'erreur SMRF)
- 60 tests unitaires: GPU, visualisations, rendering, DTM, pipeline, CLI
- Ajout pytest au Dockerfile
2026-05-10 00:57:39 +02:00
405b0d20f8 Refactor pipeline en modules + logging verbose/debug + options CLI
- Découpage du monolithe process_lidar.py (~2750 lignes) en package
  lidar_pipeline/ avec 9 modules (gpu, dtm, visualizations, ign,
  rendering, pipeline, cli, __init__, __main__)
- Logging configurable: -v (verbose avec timestamps) et --debug
  (détails internes fichier:ligne)
- Option --force pour régénérer tous les fichiers (par défaut skip
  les WebP existants)
- Option --file NOM pour traiter un seul fichier LAZ (tests rapides)
- ProcessPoolExecutor avec répertoires temporaires uniques par worker
- Suppression du code mort (geomorphons, hillshade_ne, nodata_mask)
- Aucun fichier TIFF résiduel après conversion WebP
- setup.py pour installation pip, stub process_lidar.py compatible
2026-05-10 00:15:29 +02:00