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5b74322077 Skip ground classification when DTM already exists
If the DTM .tif exists and --force is not set, skip both ground
classification and DTM generation entirely. Previously, the pipeline
would spend 3+ minutes reclassifying ground even when the DTM was
already present and would be reused anyway.

Also includes: SharedDEM cache, enhanced WebP cartouche (compass rose,
adaptive scale bar, enriched info bar), removed COG/viewer, UTF-8
fix for parallel workers, skip logic for DTM and PDF.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-13 23:41:21 +02:00
2986400a0a Layout uniforme WebP: axes fixes + aspect='equal' pour superposition géolocalisée
- Positions d'axes fixes (data_left/bottom/width/height_frac) pour alignement
  pixel-parfait entre terrain et ortho/topo
- aspect='equal' au lieu de 'auto' pour conserver les proportions géographiques
- Colorbar descriptive pour les visualisations RGB (ortho/topo)
- Comblage des petits trous DTM (< 1m) via rasterio.fill.fillnodata
- Suppression de la visualisation "dépressions"
- Hillshade composite: 0.7*hillshade + 0.3*cos(slope)
- D8 flow accumulation accéléré par numba JIT (fallback Python)
- Flag --keep-tif pour conserver les TIFF intermédiaires
- --force supprime aussi les TIF existants avant régénération
- ETA affiché pendant la génération des visualisations
- Répertoires temp dans temp/ pour traitement parallèle

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 14:46:31 +02:00
f03b3873bd Suppression de la visualisation Texture GLCM
- Suppression de generate_texture() de visualizations.py
- Suppression de l'entrée 'texture' de VIZ_STEPS et COLORMAPS
- Suppression du test TestTexture
- Mise à jour README (19 → 18 visualisations)
- Mise à jour CLAUDE.md (17 → 16 fonctions generate_*)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 03:30:07 +02:00
569f2e680c Fix numpy warnings: MaskedArray partition et Mean of empty slice
- Convert MaskedArray to ndarray avant np.percentile() via
  np.asarray(data.compressed()) et np.ma.filled(data, np.nan)
- Supprimer RuntimeWarning "Mean of empty slice" dans MSRM et
  ondelette avec warnings.catch_warnings()
- Ajout import warnings dans visualizations.py

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 03:02:36 +02:00
e2845b9e6d Pipeline LiDAR: classification sol auto + pré-traitement ELM + fix warnings
- Ajout classification automatique du sol (SMRF/PMF/CSF) avec détection
  heuristique (ratio retours uniques > 0.6 → PMF urbain, sinon SMRF)
- Pré-traitement PDAL recommandé avant classification: ELM + outlier
  removal (cell=5.0, threshold=2.0 adapté au calcaire rocailleux)
- Options CLI: --ground-classification {auto,smrf,pmf,csf} et
  --force-classification pour forcer la reclassification
- Fix double logging (logger.propagate = False)
- Fix --force non transmis dans run.sh (réécriture parsing arguments)
- Fix warning numpy 'partition will ignore mask': conversion MaskedArray
  en ndarray avant np.percentile()
- Ajout liblaszip8 + lazrs pour support LAZ dans Docker et laspy
- Tests unitaires pour PMF, CSF et auto-détection

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 03:00:33 +02:00
bf4e42d571 Supprimer les RuntimeWarnings: NaN dans nanmean et cast uint8
Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 01:29:03 +02:00
a654ff5964 Préserver les zones sans données: NaN-aware filtering dans les visualisations
- DTM: plus d'interpolation, les zones sans LiDAR restent NaN
- Ajout _fill_nans() et _filter_nanaware(): remplissent les NaN par
  nearest-neighbor avant filtrage, puis restaurent le masque NaN
- Toutes les visualisations avec filtres (LRM, MSLRM, TPI, SAILORE,
  roughness, anomalies, wavelet) utilisent _filter_nanaware pour
  éviter l'érosion des bords de données
- _save_tif() écrit nodata=float('nan') quand le tableau contient des NaN
- Les zones sans données restent vides dans les visualisations
- Les calculs ne sont pas faussés par des valeurs interpolées

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 01:24:36 +02:00
52409a6510 Pas d'interpolation dans le DTM: les zones sans données restent NaN
- Suppression de l'interpolation NearestNDInterpolator dans create_dtm_fast
- Les pixels sans données LiDAR restent NaN dans le DTM et les
  visualisations — pas de valeurs fictives qui faussent les calculs
- nodata=float('nan') dans le GeoTIFF de sortie pour identifier les vides
- _save_tif() détecte automatiquement les NaN et écrit le flag nodata

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 01:17:48 +02:00
ad762e682d Suppression éclairage solaire, GPU accéléré, --file multi, tests unitaires
- Suppression de generate_solar (éclairage solaire) des visualisations
- Accélération GPU de hillshade, slope, aspect, curvature, depressions,
  anomalies, roughness, texture GLCM, flow (sink filling)
- Nettoyage mémoire GPU entre visualisations (gpu_cleanup)
- Correction OOM texture GLCM: calcul entropie bin par bin au lieu d'un
  tableau 3D massif sur GPU
- Correction bug: xp_minimum_filter manquant dans imports visualizations
- Option --file accepte plusieurs noms complets sans extension
- run.sh affiche l'aide si appelé sans arguments
- Option --test pour exécuter les tests unitaires dans Docker
- Filtre ReturnNumber>=1 intégré dans le pipeline PDAL (plus d'erreur SMRF)
- 60 tests unitaires: GPU, visualisations, rendering, DTM, pipeline, CLI
- Ajout pytest au Dockerfile

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 00:57:39 +02:00
f07e915f6d Refactor pipeline en modules + logging verbose/debug + options CLI
- Découpage du monolithe process_lidar.py (~2750 lignes) en package
  lidar_pipeline/ avec 9 modules (gpu, dtm, visualizations, ign,
  rendering, pipeline, cli, __init__, __main__)
- Logging configurable: -v (verbose avec timestamps) et --debug
  (détails internes fichier:ligne)
- Option --force pour régénérer tous les fichiers (par défaut skip
  les WebP existants)
- Option --file NOM pour traiter un seul fichier LAZ (tests rapides)
- ProcessPoolExecutor avec répertoires temporaires uniques par worker
- Suppression du code mort (geomorphons, hillshade_ne, nodata_mask)
- Aucun fichier TIFF résiduel après conversion WebP
- setup.py pour installation pip, stub process_lidar.py compatible

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
2026-05-10 00:15:29 +02:00