"""DTM generation from classified LiDAR point clouds. Handles ground classification via PDAL (IGN supplier pre-classification, SMRF or CSF) and DTM rasterisation using scipy binned_statistic_2d. Gaps without LiDAR data (common in complex/rocky terrain) are filled with a terrain-aware interpolation so the DTM stays continuous. """ import json import logging import subprocess from pathlib import Path import numpy as np import rasterio from rasterio.transform import from_bounds from scipy.stats import binned_statistic_2d logger = logging.getLogger("lidar") # Classes LAS exploitables de la pré-classification LiDAR HD (noms → codes) IGN_CLASS_NAMES = { "sol": 2, "unclassified": 1, "non-classe": 1, "eau": 9, "virtuel": 66, "pont": 17, "sursol": 64, } # Calage vertical des faisceaux de vol (strip alignment). Une tuile LiDAR HD # est couverte par plusieurs passes d'acquisition, chacune portée par un ou # deux PointSourceId (faisceaux). Les passes sont bien alignées horizontalement # mais certains faisceaux portent un biais vertical de quelques cm (mesuré # jusqu'à ~5 cm sur LHD_FXX_1000_6882 : les deux faisceaux d'une passe écartés # de ±2,5 cm). À 0,2 m/px ces écarts créent des marches et du bruit aux # coutures des zones de recouvrement. On mesure l'offset robuste de chaque # faisceau sur les points sol de la tuile elle-même (les PointSourceId changent # selon la campagne, rien n'est codé en dur) et on le retranche avant # rastérisation. Les offsets dérivent le long d'une ligne de vol (signe inversé # entre tuiles voisines mesuré) : le calcul est donc par tuile, jamais global. # # 2ᵉ passe — gigue intra-faisceau : le décalage vertical peut aussi varier au # fil d'une MÊME passe (vibration capteur / bruit haute fréquence de la # trajectoire) : les lignes de balayage successives d'un faisceau apparaissent # alors décalées verticalement de façon aléatoire. Chaque faisceau est découpé # en fenêtres de temps GPS, l'offset robuste de chaque fenêtre est mesuré contre # la surface médiane des autres faisceaux (même maille 1 m), la série est lissée # (médiane glissante) puis interpolée au temps GPS de chaque point. Requiert la # dimension gps_time (ignorée silencieusement sinon). STRIP_ALIGN_VERSION = 2 STRIP_ALIGN_THRESHOLD = 0.005 # m : écart mini pour corriger un faisceau (0,5 cm) STRIP_ALIGN_CELL = 1.0 # m : maille de comparaison des faisceaux STRIP_ALIGN_MIN_SHARED = 500 # cellules sol communes mini pour valider un offset STRIP_JITTER_BIN = 0.1 # s : durée d'une fenêtre de temps GPS (gigue) STRIP_JITTER_SMOOTH = 5 # fenêtres : largeur de la médiane glissante STRIP_JITTER_MIN_CELLS = 40 # cellules sol partagées mini pour valider une fenêtre STRIP_JITTER_MAX = 0.10 # m : amplitude maxi d'une correction de gigue (garde-fou) # Mémo des offsets par fichier : la classification est partagée entre # résolutions, le même LAS sol est rasterisé à 0,5 m puis 0,2 m. _STRIP_OFFSETS_CACHE = {} _STRIP_JITTER_CACHE = {} def _strip_surface_grid(x, y, z, inv, n_sources, cell=STRIP_ALIGN_CELL): """Surfaces sol par faisceau sur maille 1 m (moyenne des points bas). Pour chaque faisceau et chaque maille : moyenne des points situés à moins de 0,5 m du minimum du faisceau dans la maille (robuste à la végétation résiduelle), mailles à ≥ 2 points seulement. Returns: (allcells, grid, key) : cellules triées, grid[faisceau, cellule] = Z moyen (NaN si absent) et clé de maille de CHAQUE point ; None si aucune surface n'est peuplée. """ x0 = np.floor(np.min(x) / cell) * cell y0 = np.floor(np.min(y) / cell) * cell xi = ((x - x0) / cell).astype(np.int64) yi = ((y - y0) / cell).astype(np.int64) ny = int(yi.max()) + 1 key = xi * ny + yi def _surface(k): m = inv == k kk, zz = key[m], z[m] order = np.argsort(kk, kind='stable') k_s, z_s = kk[order], zz[order] starts = np.flatnonzero(np.r_[True, k_s[1:] != k_s[:-1]]) mins = np.minimum.reduceat(z_s, starts) ukey = k_s[starts] thr = mins[np.searchsorted(ukey, kk)] sel = np.flatnonzero(zz <= thr + 0.5) k2, z2 = kk[sel], zz[sel] cnt = np.bincount(k2) sums = np.bincount(k2, weights=z2) v = np.flatnonzero(cnt >= 2) return v, sums[v] / cnt[v] surfaces = [_surface(k) for k in range(n_sources)] populated = [c for c, _ in surfaces if len(c)] if not populated: return None allcells = np.unique(np.concatenate(populated)) grid = np.full((n_sources, len(allcells)), np.nan) for k, (c, zs) in enumerate(surfaces): grid[k, np.searchsorted(allcells, c)] = zs return allcells, grid, key def _strip_vertical_offsets(x, y, z, psid, cell=STRIP_ALIGN_CELL, threshold=STRIP_ALIGN_THRESHOLD, min_shared=STRIP_ALIGN_MIN_SHARED): """Mesure les offsets verticaux relatifs entre faisceaux d'une tuile. Méthode : surface sol par faisceau (moyenne des points à moins de 0,5 m du minimum de chaque maille de 1 m, robuste à la végétation résiduelle), puis offset de chaque faisceau = médiane de l'écart à la surface médiane de référence (itéré 3 fois), sur les seules cellules couvertes par au moins deux faisceaux. Ne corrige rien d'autre que le vertical : le calage horizontal mesuré sur les données est excellent (≤ 1 cm). Args: x, y, z, psid: coordonnées et PointSourceId des points sol. cell: taille de maille de comparaison (m). threshold: seuil (m) en dessous duquel un offset est ignoré. min_shared: cellules communes minimales pour valider un faisceau. Returns: dict {psid: offset} des offsets à SOUSTRAIRE (z - offset), ne contenant que les |offset| >= threshold ; vide si rien à corriger (faisceau unique, pas de recouvrement, tuile déjà alignée). """ us, inv = np.unique(psid, return_inverse=True) if len(us) < 2: return {} built = _strip_surface_grid(x, y, z, inv, len(us), cell) if built is None: return {} allcells, grid, _key = built comparable = np.sum(~np.isnan(grid), axis=0) >= 2 offsets = np.zeros(len(us)) for _ in range(3): ref = np.nanmedian(grid + offsets[:, None], axis=0) for k in range(len(us)): m = ~np.isnan(grid[k]) & comparable if int(m.sum()) >= min_shared: offsets[k] = np.median(grid[k][m] - ref[m]) return {int(p): round(float(offsets[k]), 3) for k, p in enumerate(us) if abs(offsets[k]) >= threshold} def _rolling_median(values, window): """Médiane glissante (fenêtre tronquée aux bords) sur un petit vecteur.""" n = len(values) if window <= 1 or n == 0: return np.array(values, dtype=np.float64) half = window // 2 return np.array([np.median(values[max(0, i - half):i + half + 1]) for i in range(n)]) def _strip_jitter_offsets(x, y, z, psid, t, cell=STRIP_ALIGN_CELL, bin_seconds=STRIP_JITTER_BIN, smooth=STRIP_JITTER_SMOOTH, min_cells=STRIP_JITTER_MIN_CELLS, max_corr=STRIP_JITTER_MAX, threshold=STRIP_ALIGN_THRESHOLD): """Mesure la gigue verticale intra-faisceau par fenêtres de temps GPS. Le calage constant retire un offset par faisceau, mais le décalage vertical peut aussi varier au fil d'une même passe (vibration capteur, bruit haute fréquence de la trajectoire). Chaque faisceau est découpé en fenêtres de temps GPS ; l'offset robuste de chaque fenêtre est mesuré contre la surface médiane des AUTRES faisceaux (maille 1 m, même sélection de points bas que le calage constant — en recouvrement à deux, une référence incluant le faisceau testé ne révélerait que la moitié du décalage), puis la série est lissée (médiane glissante) pour ne pas suivre le bruit de mesure. z doit déjà être corrigé des offsets constants. Args: x, y, z, psid: coordonnées, Z (constant-calé) et PointSourceId des points sol. t: temps GPS (s) de chaque point. cell: taille de maille de comparaison (m). bin_seconds: durée d'une fenêtre de temps (s). smooth: largeur de la médiane glissante (fenêtres). min_cells: cellules partagées minimales pour valider une fenêtre. max_corr: amplitude maximale d'une correction (garde-fou, m). threshold: amplitude de série sous laquelle un faisceau est considéré comme stable (pas de correction). Returns: dict {psid: (times, corrections)} des corrections à SOUSTRAIRE, interpolables linéairement au temps GPS de chaque point ; vide si rien de mesurable (faisceau unique, temps absent, pas de recouvrement). """ us, inv = np.unique(psid, return_inverse=True) if len(us) < 2: return {} t = np.asarray(t, dtype=np.float64) if t.size != z.size or not np.isfinite(t).all(): return {} built = _strip_surface_grid(x, y, z, inv, len(us), cell) if built is None: return {} allcells, grid, key = built covered = np.sum(~np.isnan(grid), axis=0) >= 2 # Référence d'un faisceau = médiane des autres faisceaux. ref = np.full(grid.shape, np.nan) if len(us) == 2: ref[0], ref[1] = grid[1], grid[0] else: import warnings with warnings.catch_warnings(): warnings.simplefilter("ignore", RuntimeWarning) # tranches tout-NaN for k in range(len(us)): ref[k] = np.nanmedian(np.delete(grid, k, axis=0), axis=0) # Résidu vertical de chaque point contre la référence de son faisceau. idx = np.minimum(np.searchsorted(allcells, key), len(allcells) - 1) ref_point = ref[inv, idx] hit = (allcells[idx] == key) & covered[idx] & np.isfinite(ref_point) residual = np.full(np.asarray(z).shape, np.nan) residual[hit] = np.asarray(z)[hit] - ref_point[hit] # Origine de temps propre à chaque faisceau : des passes d'une même tuile # peuvent être espacées de plusieurs heures, les fenêtres restent ainsi # dense autour du vol réel (et un saut de semaine GPS ne crée pas de # géantes plages vides). origin = np.full(len(us), np.inf) np.minimum.at(origin, inv, t) tb = np.floor((t - origin[inv]) / bin_seconds).astype(np.int64) n_bins = int(tb.max()) + 1 group = inv * n_bins + tb # Médiane robuste par groupe (faisceau, fenêtre) : les résidus finis sont # triés en tête de segment, les NaN (sans référence) sont ignorés. order = np.lexsort((np.where(np.isfinite(residual), residual, np.inf), group)) g_s, r_s = group[order], residual[order] starts = np.flatnonzero(np.r_[True, g_s[1:] != g_s[:-1]]) ends = np.r_[starts[1:], len(g_s)] gids, times_c, med = [], [], [] for s, e in zip(starts, ends): finite = np.isfinite(r_s[s:e]) if int(finite.sum()) < min_cells: continue gids.append(int(g_s[s])) med.append(float(np.median(r_s[s:e][finite]))) if not gids: return {} gids = np.asarray(gids, dtype=np.int64) med = np.asarray(med, dtype=np.float64) result = {} for k in range(len(us)): selk = gids // n_bins == k if int(selk.sum()) < 3: # série trop courte : correction non fiable continue b = gids[selk] % n_bins cs = np.clip(_rolling_median(med[selk], smooth), -max_corr, max_corr) if float(np.max(np.abs(cs))) < threshold: continue result[int(us[k])] = (origin[k] + (b + 0.5) * bin_seconds, cs) return result def _apply_strip_jitter(psid, t, jitter): """Corrections de gigue interpolées au temps GPS de chaque point. Args: psid, t: PointSourceId et temps GPS (s) de chaque point. jitter: dict {psid: (times, corrections)} issu de _strip_jitter_offsets. Returns: array des corrections à SOUSTRAIRE (0 pour les points sans série). """ corr = np.zeros(len(t)) if not jitter: return corr psid = np.asarray(psid) t = np.asarray(t, dtype=np.float64) for p, (times, cs) in jitter.items(): m = psid == p if m.any(): corr[m] = np.interp(t[m], times, cs) return corr def _strip_jitter_for_file(las_file, las, offsets): """Gigue temporelle d'un LAS sol (offsets constants mesurés), mémoïsée.""" try: p = Path(las_file) cache_key = (str(p), p.stat().st_mtime_ns) except OSError: cache_key = (str(las_file), 0) if cache_key in _STRIP_JITTER_CACHE: return _STRIP_JITTER_CACHE[cache_key] jitter = {} try: t = np.asarray(las.gps_time, dtype=np.float64) psid = np.asarray(las.point_source_id) except AttributeError: t, psid = None, None # dimensions absentes : pas de gigue mesurable if (t is not None and psid is not None and len(t) == len(las.points) == len(psid)): z = np.asarray(las.z, dtype=np.float64) if offsets: lut = np.zeros(65536) for p_, off in offsets.items(): lut[int(p_) & 0xFFFF] = off z = z - lut[np.asarray(las.point_source_id, dtype=np.int64)] jitter = _strip_jitter_offsets( np.asarray(las.x, dtype=np.float64), np.asarray(las.y, dtype=np.float64), z, psid, t) _STRIP_JITTER_CACHE[cache_key] = jitter return jitter def _strip_offsets_for_file(las_file, las): """Offsets de calage d'un LAS sol, mémoïsés par (chemin, mtime).""" try: p = Path(las_file) cache_key = (str(p), p.stat().st_mtime_ns) except OSError: cache_key = (str(las_file), 0) if cache_key in _STRIP_OFFSETS_CACHE: return _STRIP_OFFSETS_CACHE[cache_key] try: psid = np.asarray(las.point_source_id) except AttributeError: psid = None # dimension absente (producteur tiers) : pas de calage if psid is not None and len(psid) == len(las.points): offsets = _strip_vertical_offsets( np.asarray(las.x, dtype=np.float64), np.asarray(las.y, dtype=np.float64), np.asarray(las.z, dtype=np.float64), psid) else: offsets = {} _STRIP_OFFSETS_CACHE[cache_key] = offsets return offsets def _write_strip_align_sidecar(dtm_dir, basename, output_suffix, offsets, jitter=None): """Consigne les calages appliqués (version, seuil, offsets et gigue). Le sidecar sert de suivi de cache : un DTM sans sidecar, ou produit avec une version/un seuil/des paramètres de gigue différents, est régénéré. Il est écrit même quand aucune correction n'a été appliquée, pour ne pas re-mesurer une tuile déjà connue comme bien alignée. """ jitter_payload = {} for p, (times, cs) in (jitter or {}).items(): cs = np.asarray(cs, dtype=np.float64) jitter_payload[str(p)] = { "bins": int(len(times)), "rms_m": round(float(np.sqrt(np.mean(cs ** 2))), 4), "max_m": round(float(np.max(np.abs(cs))), 4), "series_m": [round(float(c), 4) for c in cs], } payload = { "version": STRIP_ALIGN_VERSION, "threshold": STRIP_ALIGN_THRESHOLD, "offsets": offsets, "jitter_bin": STRIP_JITTER_BIN, "jitter_smooth": STRIP_JITTER_SMOOTH, "jitter": jitter_payload, } try: sidecar = Path(dtm_dir) / f"{basename}_dtm{output_suffix}_stripalign.json" sidecar.write_text(json.dumps(payload, ensure_ascii=False), encoding="utf-8") except Exception as e: logger.warning(f" Écriture sidecar calage faisceaux impossible: {e}") def _strip_lidar_ext(path): """Extract base name from a LAZ/LAS file (mirrors pipeline._file_basename).""" name = Path(path).name for ext in ('.copc.laz', '.copc.las', '.laz', '.las'): if name.lower().endswith(ext): return name[:-len(ext)] return Path(path).stem def parse_ign_classes(spec): """Convertit une liste de classes IGN (noms ou codes) en codes LAS triés. Args: spec: Chaîne séparée par virgules, ex. "sol,unclassified" ou "2,1". Returns: Liste triée de codes LAS uniques. Raises: ValueError: Si un élément n'est ni un nom connu ni un code LAS 0-255, ou si la liste est vide. """ codes = set() for token in str(spec).split(","): token = token.strip().lower() if not token: continue if token in IGN_CLASS_NAMES: codes.add(IGN_CLASS_NAMES[token]) else: try: code = int(token) except ValueError: raise ValueError( f"Classe IGN inconnue: '{token}' " f"(noms: {', '.join(sorted(IGN_CLASS_NAMES))} ou code LAS 0-255)") if not 0 <= code <= 255: raise ValueError(f"Code LAS hors bornes (0-255): {code}") codes.add(code) if not codes: raise ValueError("Aucune classe IGN fournie") return sorted(codes) def ign_method_label(codes): """Étiquette de méthode encodant les classes IGN (ex. 'ign_1_2'). 'ign' seul = sol uniquement (code 2), rétrocompatible avec les fichiers de classification existants. Toute autre combinaison est encodée dans le nom pour invalider le cache et déclencher la reclassification. """ codes = sorted(codes) if codes == [2]: return "ign" return "ign_" + "_".join(str(c) for c in codes) def _create_ground_pipeline(input_laz, output_las, method, ign_codes=None): """Create a PDAL pipeline JSON for ground classification. All methods include a ReturnNumber/NumberOfReturns >= 1 filter to handle LiDAR HD files that may contain points with invalid return numbers. Pre-processing steps (PDAL recommended workflow): 1. Reset Classification to 0 2. ELM (Extended Local Minimum) — mark low outliers as noise (Classification=7) 3. Statistical outlier removal 4. Ground classification (SMRF or CSF) 5. Extract ground points (Classification=2) Args: input_laz: Path to input LAZ/LAS file. output_las: Path to output classified LAS file. method: Ground classification method ('ign', 'smrf' or 'csf'). ign_codes: LAS class codes to extract with the 'ign' method (default: [2] = sol). Multiple ranges on Classification are logically ORed by filters.range (documented PDAL semantics). Returns: JSON string of the PDAL pipeline. """ # Common ReturnNumber filter for LiDAR HD compatibility return_filter = { "type": "filters.range", "limits": "ReturnNumber[1:],NumberOfReturns[1:]" } # Classification filter (ground points only) ground_filter = { "type": "filters.range", "limits": "Classification[2:2]" } # LiDAR HD IGN : le fichier est pré-classifié par le fournisseur. # On réutilise la classification telle quelle (mode pur) : les classes # extraites sont paramétrables — par défaut le sol seul (2), mais on peut # ajouter p.ex. unclassified (1) pour combler les trous sans retouche. # Les plages multiples sur Classification sont combinées en OU logique # par filters.range (sémantique PDAL documentée). if method == 'ign': codes = sorted(ign_codes) if ign_codes else [2] ign_filter = { "type": "filters.range", "limits": ",".join(f"Classification[{c}:{c}]" for c in codes) } pipeline = { "pipeline": [ str(input_laz), return_filter, ign_filter, { "type": "writers.las", "filename": str(output_las), "extra_dims": "all" } ] } return json.dumps(pipeline) # Reset Classification to 0 before preprocessing reset_classification = { "type": "filters.assign", "assignment": "Classification[:]=0" } # ELM (Extended Local Minimum) — mark low outliers as noise # Parameters tuned for rocky limestone terrain with low vegetation: # - cell=5.0m: fine resolution to capture rocky relief # - threshold=2.0m: high threshold to avoid marking rock outcrops as noise elm_filter = { "type": "filters.elm", "cell": 5.0, "threshold": 2.0 } # Statistical outlier removal outlier_filter = { "type": "filters.outlier", "method": "statistical", "mean_k": 8, "multiplier": 3.0 } # Method-specific ground classification filter if method == 'smrf': ground_step = { "type": "filters.smrf", "ignore": "Classification[7:7]", "slope": 1.0, "window": 16.0, "threshold": 0.5, "scalar": 1.25 } elif method == 'csf': # resolution 1.0 m : un cloth à 0.5 m (= 4 M particules pour 1 km²) # rend la classification ~4× plus lente sans gain visible sur le MNT # (la résolution finale du MNT vient de la rasterisation, pas du cloth). ground_step = { "type": "filters.csf", "resolution": 1.0, "rigidness": 3, "smooth": True, "threshold": 0.5 } else: raise ValueError(f"Méthode de classification inconnue: {method}") pipeline = { "pipeline": [ str(input_laz), return_filter, reset_classification, elm_filter, outlier_filter, ground_step, ground_filter, { "type": "writers.las", "filename": str(output_las), "extra_dims": "all" } ] } return json.dumps(pipeline) def create_smrf_pipeline(input_laz, output_las): """Create a PDAL pipeline JSON for SMRF ground classification.""" return _create_ground_pipeline(input_laz, output_las, 'smrf') def create_ign_pipeline(input_laz, output_las): """Create a PDAL pipeline JSON using the IGN supplier pre-classification.""" return _create_ground_pipeline(input_laz, output_las, 'ign') def create_csf_pipeline(input_laz, output_las): """Create a PDAL pipeline JSON for CSF ground classification.""" return _create_ground_pipeline(input_laz, output_las, 'csf') def validate_laz(laz_file): """Integrity check for a LAZ/LAS file. Verifies that both the header AND point data are readable. Some corrupted COPC files have valid headers but inaccessible point data (LazrsError: failed to fill whole buffer). Such files must be re-downloaded. Returns: True if file is readable and contains accessible points, False otherwise. """ import laspy try: with laspy.open(str(laz_file)) as f: header = f.header point_count = header.point_count if point_count == 0: logger.error(f" ✗ Fichier vide (0 points): {laz_file.name}") logger.error(f" → Re-télécharger depuis https://ign.fr/lidar-hd") return False # Verify point data is actually accessible (not just header metadata) try: for _ in f.chunk_iterator(1000): break # Read just one chunk to confirm data integrity except Exception as chunk_err: logger.error(f" ✗ Données inaccessibles (fichier corrompu?): {laz_file.name}") logger.error(f" Erreur: {chunk_err}") logger.error(f" → Re-télécharger depuis https://ign.fr/lidar-hd") return False return True except Exception: pass # Fallback: try PDAL (handles COPC v1.1 that laspy can't read) try: result = subprocess.run( ["pdal", "info", str(laz_file), "--summary"], capture_output=True, text=True, timeout=30 ) if result.returncode == 0: # Check point count from PDAL info output import json as _json try: info = _json.loads(result.stdout) count = info.get('summary', {}).get('num_points', 0) if count == 0: logger.error(f" ✗ Fichier vide (0 points PDAL): {laz_file.name}") logger.error(f" → Re-télécharger depuis https://ign.fr/lidar-hd") return False except Exception: pass # Can't parse — assume valid # Verify PDAL can actually read point data (not just header) try: test_result = subprocess.run( ["pdal", "info", str(laz_file), "--point", "1"], capture_output=True, text=True, timeout=60 ) if test_result.returncode != 0: logger.error(f" ✗ Données inaccessibles (PDAL): {laz_file.name}") logger.error(f" → Re-télécharger depuis https://ign.fr/lidar-hd") return False except (subprocess.TimeoutExpired, FileNotFoundError): pass # Timeout — assume valid, will fail later if corrupted return True logger.error(f" ✗ Fichier illisible: {laz_file.name}") logger.error(f" PDAL: {result.stderr.strip()[:200]}") except (subprocess.TimeoutExpired, FileNotFoundError): logger.error(f" ✗ Impossible de vérifier le fichier: {laz_file.name}") logger.error(f" → Re-télécharger depuis https://ign.fr/lidar-hd") return False def _read_with_pdal(laz_file): """Read a LAZ/LAS file via PDAL when laspy fails (e.g. COPC v1.1). Returns a laspy.LasData object, or None on failure. """ import subprocess import tempfile import os tmp_path = None try: # Convert COPC to LAS via PDAL, then read with laspy with tempfile.NamedTemporaryFile(suffix='.las', delete=False) as tmp: tmp_path = tmp.name pipeline = json.dumps({ "pipeline": [ str(laz_file), {"type": "writers.las", "filename": tmp_path} ] }) result = subprocess.run( ["pdal", "pipeline", "--stdin"], input=pipeline, capture_output=True, text=True, timeout=300 ) if result.returncode != 0: logger.warning(f" PDAL conversion échouée: {result.stderr[:200]}") return None import laspy las = laspy.read(tmp_path) if len(las.points) == 0: logger.warning(f" PDAL: conversion réussie mais 0 points") return None return las except Exception as e: logger.warning(f" PDAL fallback échoué: {e}") return None finally: # Toujours supprimer le LAS temporaire, même en cas d'exception # (timeout subprocess, laspy.read échoué…) : sinon fuite de ~Go. if tmp_path: try: os.unlink(tmp_path) except Exception: pass def detect_ground_method(laz_file): """Detect the best ground classification method based on point cloud statistics. Auto-selects between SMRF and CSF: - SMRF: fast, robust for most natural terrain (PDAL recommended default) - CSF: cloth simulation, better for complex/urban terrain Falls back to SMRF if the file cannot be read or attributes are missing. Args: laz_file: Path to input LAZ/LAS file. Returns: String: 'ign', 'smrf' or 'csf' """ import laspy # Try laspy first, then PDAL for COPC files las = None try: las = laspy.read(str(laz_file)) except Exception as e: logger.warning(f" laspy: {e}") logger.info(f" → Lecture via PDAL pour auto-détection...") las = _read_with_pdal(laz_file) if las is None: logger.info(f" → Méthode: SMRF (défaut — lecture impossible)") return 'smrf' total_points = len(las.points) if total_points == 0: logger.warning(f" Nuage vide (0 points) — méthode par défaut: SMRF") return 'smrf' # LiDAR HD IGN : les données livrées sont pré-classifiées par le fournisseur # (classe 2 = sol). C'est la base la plus rapide (~10 s) et de référence. # Le MNT est ensuite complété par le retour le plus bas par cellule + # interpolation (voir create_dtm_fast), ce qui « rattrape » les trous de la # pré-classification (forêt dense / relief). On la préfère donc dès qu'une # part raisonnable des points est classée sol, plutôt que de refiltrer. try: cls = np.asarray(las.classification, dtype=np.int32) ground_ratio = float(np.mean(cls == 2)) except Exception: ground_ratio = 0.0 if ground_ratio >= 0.2: logger.info(f" → Méthode: IGN (pré-classification fournisseur — " f"{ground_ratio * 100:.1f}% de points classe 2)") return 'ign' z = np.array(las.z) # Height variance (always available) z_std = float(np.std(z)) z_range = float(np.max(z) - np.min(z)) # Try to get NumberOfReturns (may not exist in all point formats) single_return_ratio = 0.0 try: num_returns = np.array(las.NumberOfReturns) single_return_count = int(np.sum(num_returns == 1)) single_return_ratio = single_return_count / total_points if total_points > 0 else 0 except AttributeError: logger.debug(" NumberOfReturns non disponible — utilisation de la variance Z uniquement") logger.info(f" Analyse du nuage: {total_points:,} points, " f"ratio_retours_uniques={single_return_ratio:.2f}, " f"écart_Z={z_std:.1f}m, amplitude_Z={z_range:.1f}m") # Decision logic: # - High single-return ratio (>0.6) → urban (buildings, roads) → CSF (cloth simulation) # - High elevation variance (>30m) → complex/mountainous terrain → CSF # - Default → SMRF (fast, robust for most natural terrain) if single_return_ratio > 0.6: method = 'csf' reason = f"ratio retours uniques={single_return_ratio:.2f} > 0.6 → milieu urbain" elif z_std > 30: method = 'csf' reason = f"écart_Z={z_std:.1f}m > 30m → terrain complexe" else: method = 'smrf' reason = f"terrain naturel standard" logger.info(f" → Méthode: {method.upper()} ({reason})") return method def classify_ground(laz_file, temp_dir, method='auto', force=False, ign_classes="sol"): """Classify ground points using PDAL ground classification filter. Args: laz_file: Path to input LAZ/LAS file. temp_dir: Directory for temporary files (pipeline.json, ground.las). method: Ground classification method ('auto', 'ign', 'smrf' or 'csf'). force: If True, reclassify even if output file already exists. ign_classes: Classes LAS extraites par la méthode IGN (noms ou codes séparés par virgules, ex. "sol,unclassified"). Ignoré pour les autres méthodes. Returns: Path to classified ground LAS file, or None on failure. """ import laspy # Auto-detect method if requested if method == 'auto': method = detect_ground_method(laz_file) logger.info(f" Classification sol: {method.upper()} (auto)") else: logger.info(f" Classification sol: {method.upper()} (forcé)") # Les classes IGN sont encodées dans le nom de fichier (ex. ign_1_2) # pour qu'un changement de classes invalide le cache et déclenche la # reclassification. ign_codes = parse_ign_classes(ign_classes) if method == 'ign' else None method_label = ign_method_label(ign_codes) if ign_codes else method laz_base = _strip_lidar_ext(laz_file) output_las = temp_dir / f"{laz_base}_ground_{method_label}.las" if output_las.exists() and not force: logger.info(f" Classification {method.upper()} déjà effectuée — fichier existant réutilisé") return output_las if force and output_las.exists(): logger.info(f" Reclassification forcée — suppression de {output_las.name}") output_las.unlink() pipeline_json = _create_ground_pipeline(laz_file, output_las, method, ign_codes=ign_codes) pipeline_file = temp_dir / f"pipeline_{method_label}.json" with open(pipeline_file, 'w') as f: f.write(pipeline_json) try: subprocess.run( ["pdal", "pipeline", str(pipeline_file)], capture_output=True, check=True ) # Verify that ground file has points if output_las.exists() and output_las.stat().st_size < 100: logger.error(f" ✗ Fichier ground vide (taille < 100 octets)") output_las.unlink(missing_ok=True) # Fallback: si la méthode ne produit aucun point sol, réessayer avec SMRF if method in ('csf', 'ign'): return _fallback_to_smrf(laz_file, temp_dir, laz_base, force, source=method_label) return None logger.info(f" ✓ Classification sol {method.upper()} terminée") return output_las except subprocess.CalledProcessError as e: error_msg = e.stderr.decode() if e.stderr else str(e) logger.warning(f" ✗ Erreur classification PDAL ({method.upper()}): {error_msg}") # Fallback: si CSF ou la pré-classification échouent, réessayer avec SMRF if method in ('csf', 'ign'): return _fallback_to_smrf(laz_file, temp_dir, laz_base, force, source=method_label) # Try repairing file with laspy if PDAL fails on EVLR/VLR if 'VLR' in error_msg or 'Invalid' in error_msg: logger.info(f" → Tentative de réparation du fichier avec laspy...") repaired_las = temp_dir / f"{laz_base}_repaired.las" if _repair_laz_with_laspy(laz_file, repaired_las): # Retry PDAL pipeline with repaired file pipeline_json = _create_ground_pipeline(repaired_las, output_las, method) with open(pipeline_file, 'w') as f: f.write(pipeline_json) try: subprocess.run( ["pdal", "pipeline", str(pipeline_file)], capture_output=True, check=True ) logger.info(f" ✓ Classification sol {method.upper()} terminée (fichier réparé)") return output_las except subprocess.CalledProcessError as e2: error_msg2 = e2.stderr.decode() if e2.stderr else str(e2) logger.error(f" ✗ Échec classification même après réparation: {error_msg2}") else: logger.error(f" ✗ Impossible de réparer le fichier") return None def _fallback_to_smrf(laz_file, temp_dir, laz_base, force=False, source='csf'): """Retry ground classification with SMRF when CSF/IGN fails. CSF (Cloth Simulation Filter) can fail on certain terrain types where SMRF (Simple Morphological Filter) succeeds, and a file without usable pre-classification produces an empty ground extract. This fallback ensures processing continues even when the selected method fails. Args: laz_file: Path to input LAZ/LAS file. temp_dir: Directory for temporary files. laz_base: Base name for the file. force: If True, reclassify even if output exists. source: Method that failed ('csf' or 'ign'). Returns: Path to classified ground LAS file, or None on failure. """ logger.info(f" → Basculement {source.upper()} → SMRF (fallback)") # Clean up failed output if it exists failed_output = temp_dir / f"{laz_base}_ground_{source}.las" if failed_output.exists(): failed_output.unlink(missing_ok=True) output_las = temp_dir / f"{laz_base}_ground_smrf.las" if output_las.exists() and not force: logger.info(f" Classification SMRF déjà existante — fichier réutilisé") return output_las pipeline_json = _create_ground_pipeline(laz_file, output_las, 'smrf') pipeline_file = temp_dir / "pipeline_smrf.json" with open(pipeline_file, 'w') as f: f.write(pipeline_json) try: subprocess.run( ["pdal", "pipeline", str(pipeline_file)], capture_output=True, check=True ) if output_las.exists() and output_las.stat().st_size < 100: logger.error(f" ✗ Fichier ground SMRF vide (taille < 100 octets)") output_las.unlink(missing_ok=True) return None logger.info(f" ✓ Classification sol SMRF terminée (fallback depuis CSF)") return output_las except subprocess.CalledProcessError as e: error_msg = e.stderr.decode() if e.stderr else str(e) logger.error(f" ✗ Échec classification SMRF (fallback): {error_msg}") return None def _repair_laz_with_laspy(input_laz, output_las): """Try to repair a corrupt LAZ file by re-reading with laspy and saving as LAS. Works around PDAL errors like 'Invalid Extended VLR size' by stripping problematic VLR/EVLR metadata during re-save. Args: input_laz: Path to corrupt LAZ/LAS file. output_las: Path for repaired LAS output. Returns: True if repair succeeded, False otherwise. """ import laspy try: las = laspy.read(str(input_laz)) las.write(str(output_las)) logger.info(f" ✓ Fichier réparé via laspy ({len(las.points):,} points)") return True except Exception as e: logger.warning(f" ✗ Réparation laspy échouée: {e}") return False def _interpolate_holes(dtm, downsample=8): """Fill remaining NaN holes with a terrain-aware surface interpolation. In complex / rocky terrain the ground under-classification leaves interior holes far too large for a 1 m gap fill, which otherwise become flat nearest-neighbor patches in the downstream layers. This helper triangulates the valid cells on a downsampled grid (linear, nearest as a fallback for cells outside the data hull) and bilinearly upsamples the result, keeping the operation fast even for large rasters. Args: dtm: 2-D float array (may contain NaN holes). downsample: Coarsening factor for the interpolation grid. Returns: Tuple (filled_array, filled_count). """ holes = np.isnan(dtm) if not holes.any(): return dtm, 0 valid = ~holes if not valid.any(): return dtm, 0 height, width = dtm.shape step = max(1, downsample) coarse = dtm[::step, ::step].astype(np.float64) c_valid = ~np.isnan(coarse) c_holes = np.isnan(coarse) if not c_holes.any() or not c_valid.any(): return dtm, 0 from scipy.interpolate import griddata from scipy.ndimage import map_coordinates cy, cx = np.where(c_valid) c_coords = np.column_stack([cx, cy]).astype(np.float64) c_vals = coarse[c_valid] hy, hx = np.where(c_holes) h_coords = np.column_stack([hx, hy]).astype(np.float64) interp = griddata(c_coords, c_vals, h_coords, method='linear') bad = np.isnan(interp) if bad.any(): interp[bad] = griddata(c_coords, c_vals, h_coords[bad], method='nearest') coarse_filled = coarse.copy() coarse_filled[c_holes] = interp # Coarse cell i represents fine column/row i*step, so fine index c maps to # coarse coordinate c/step (no half-cell offset). rows = np.arange(height) / step cols = np.arange(width) / step grid_y, grid_x = np.meshgrid(rows, cols, indexing='ij') upsampled = map_coordinates(coarse_filled, [grid_y, grid_x], order=1) filled = dtm.copy() filled[holes] = upsampled[holes] return filled, int(holes.sum()) # ------------------------------------------------------------ # Raccord des bords (edge buffer avec les tuiles adjacentes) # ------------------------------------------------------------ # Les visualisations à grand noyau (openness/SVF : rayons jusqu'à 100 m, # LRM : 15 m) tronquent leur fenêtre au bord de la dalle : les rendus # présentent alors une bande d'artefacts à chaque changement de tuile. Avec # edge_buffer > 0, le MNT est rastérisé sur la dalle nominale 1 km ÉTENDUE # d'une bande de `edge_buffer` mètres remplie avec les points sol des 8 # tuiles LAZ voisines (lecture PDAL en flux : découpe + filtre de classes). # Les visualisations voient ainsi le terrain réel au-delà du bord, et les # images finales sont recadrées sur la dalle exacte (cf. rendering.py). EDGE_BUFFER_TAG = "LIDAR_EDGE_BUFFER" # tag GeoTIFF : tampon utilisé (m) # Sous-dossier de input/ où sont isolées les dalles voisines téléchargées # pour le seul raccord des bords : elles ne font pas partie du corpus de # tuiles à rendre (les scans globaux n'énumèrent que input/ à plat). EDGE_NEIGHBORS_DIRNAME = "edge_neighbors" # Décalages des 8 voisines d'une dalle (col, row) en km _NEIGHBOR_OFFSETS = [(-1, -1), (0, -1), (1, -1), (-1, 0), (1, 0), (-1, 1), (0, 1), (1, 1)] def _tile_coords(name): """Coordonnées (col, row) en km d'un nom de fichier LHD, ou None.""" from .index import parse_basename_coords return parse_basename_coords(Path(name).name) def _neighbor_laz_files(source_laz): """Liste les 8 fichiers LAZ/LAS adjacents à `source_laz`. Recherche dans le dossier de la source, puis dans le sous-dossier edge_neighbors/ : les dalles voisines téléchargées pour le seul raccord des bords y sont isolées — sinon elles s'accumulent à plat dans input/ et chaque passe globale annexe un anneau de tuiles à rendre en plus. """ coords = _tile_coords(source_laz) if coords is None: return [] col, row = coords directory = Path(source_laz).parent search_dirs = [directory, directory / EDGE_NEIGHBORS_DIRNAME] neighbors = [] for dcol, drow in _NEIGHBOR_OFFSETS: nc, nr = col + dcol, row + drow # Noms LHD : col/row en km sur 4 chiffres complétés (ex. 0638_6628) ; # on accepte aussi la variante sans remplissage pour les dalles exotiques. names = {f"LHD_FXX_{nc:04d}_{nr:04d}", f"LHD_FXX_{nc}_{nr}"} matches = [] for search_dir in search_dirs: for name in names: matches += list(search_dir.glob(f"{name}_*.las")) matches += list(search_dir.glob(f"{name}_*.laz")) if matches: neighbors.append(sorted(matches)[0]) else: logger.debug(f" Voisine absente : LHD_FXX_{nc:04d}_{nr:04d} (bande de bord vide)") return neighbors def _neighbor_ground_points(source_laz, bounds, classes): """Points sol des tuiles voisines dans `bounds` (raccord des bords). Lecture PDAL en flux par voisine : découpe sur l'emprise étendue puis filtre de classes (mêmes codes que le MNT). Best-effort : une voisine illisible ou absente est ignorée — la bande correspondante reste vide. Args: source_laz: LAZ de la tuile traitée (repère pour trouver les voisines). bounds: (min_x, min_y, max_x, max_y) de l'emprise étendue. classes: codes LAS à extraire (ex. [2] = sol). Returns: (xs, ys, zs) concaténés (tableaux vides si aucune voisine). """ import tempfile neighbors = _neighbor_laz_files(source_laz) if not neighbors: return (np.empty(0),) * 3 min_x, min_y, max_x, max_y = bounds codes = sorted(set(int(c) for c in classes)) or [2] limits = ",".join(f"Classification[{c}:{c}]" for c in codes) xs, ys, zs = [], [], [] found = 0 for neighbor in neighbors: tmp_path = None try: with tempfile.NamedTemporaryFile(suffix='.las', delete=False) as tmp: tmp_path = tmp.name pipeline = json.dumps({ "pipeline": [ {"type": "readers.las", "filename": str(neighbor)}, {"type": "filters.crop", "bounds": f"([{min_x},{max_x}],[{min_y},{max_y}])"}, {"type": "filters.range", "limits": limits}, {"type": "writers.las", "filename": tmp_path}, ] }) result = subprocess.run( ["pdal", "pipeline", "--stdin"], input=pipeline, capture_output=True, text=True, timeout=300 ) if result.returncode != 0: raise RuntimeError(result.stderr[:200]) import laspy las = laspy.read(tmp_path) if len(las.points) > 0: xs.append(np.asarray(las.x, dtype=np.float64)) ys.append(np.asarray(las.y, dtype=np.float64)) zs.append(np.asarray(las.z, dtype=np.float64)) found += 1 except Exception as e: logger.debug(f" Voisine {Path(neighbor).name} ignorée : {e}") finally: if tmp_path: try: Path(tmp_path).unlink(missing_ok=True) except Exception: pass if not found: logger.warning(" Aucune voisine lisible — bande de bord vide") return (np.empty(0),) * 3 logger.info(f" Raccord bords : {found} voisine(s), " f"{sum(len(a) for a in xs):,} pts sol") return np.concatenate(xs), np.concatenate(ys), np.concatenate(zs) def read_dtm_edge_buffer(dtm_path): """Tampon de raccord enregistré dans un DTM (m ; 0 si absent/illisible).""" try: with rasterio.open(dtm_path) as src: tags = src.tags() return float(tags.get(EDGE_BUFFER_TAG, 0.0) or 0.0) except Exception: return 0.0 def create_dtm_fast(las_file, basename, dtm_dir, resolution, force=False, output_suffix="", source_laz=None, pure=False, strip_align=True, edge_buffer=0.0, neighbor_classes=None): """Create DTM using fast binning method with gap filling. Args: las_file: Path to classified ground LAS file. basename: Base name for output file. dtm_dir: Directory for output DTM GeoTIFF. resolution: Grid resolution in meters per pixel. force: If True, regenerate even if DTM already exists. output_suffix: Suffix for output filename (e.g. '_r0p2' for additional resolutions). source_laz: Optionnel : LAZ complet de la tuile traitée (repère pour lire les 8 tuiles voisines du raccord de bords, cf. edge_buffer). pure: Sans effet (conservé pour compatibilité). Fonctionnement historique rétabli : petits trous comblés par fillnodata, grands trous laissés en nodata (rendus en noir dans les rendus). strip_align: Si True (défaut), mesure et corrige les écarts verticaux entre faisceaux de vol (PointSourceId) avant rastérisation : offsets constants ≥ STRIP_ALIGN_THRESHOLD (0,5 cm) puis gigue intra-faisceau par fenêtres de temps GPS ; tout est consigné dans un sidecar *_dtm*_stripalign.json. edge_buffer: Raccord des bords en mètres (0 = désactivé). Le MNT couvre alors la dalle nominale 1 km étendue de cette bande, remplie avec les points sol des 8 tuiles LAZ voisines (source_laz requis) ; les visualisations calculent sur l'emprise étendue puis les images sont recadrées sur la dalle exacte (rendering.py). Le tampon est inscrit dans le tag GeoTIFF LIDAR_EDGE_BUFFER pour l'invalidation du cache. neighbor_classes: codes LAS extraits chez les voisines (défaut : les classes IGN du MNT, ex. [2]). Les voisines sont lues dans leur pré-classification fournisseur, même si la tuile centrale est classée SMRF/CSF (bande de contexte, quelques cm d'écart au pire). Returns: Path to output DTM GeoTIFF, or None on failure. """ output_tif = dtm_dir / f"{basename}_dtm{output_suffix}.tif" if output_tif.exists() and not force: logger.info(f" DTM déjà existant — fichier réutilisé: {output_tif.name}") return output_tif import laspy logger.info(" → Génération DTM...") try: las = laspy.read(str(las_file)) except Exception as e: # laspy can't read COPC v1.1 — try PDAL conversion logger.warning(f" laspy: {e}") logger.info(f" → Conversion via PDAL pour lecture COPC...") las = _read_with_pdal(las_file) if las is None: logger.error(f" ✗ Impossible de lire {las_file.name}") return None if len(las.points) == 0: logger.error(f" ✗ Fichier vide (0 points): {las_file.name}") return None # Calage vertical des faisceaux de vol avant rastérisation : best-effort, # en cas d'échec de la mesure on continue non calé (jamais d'abort). strip_offsets = {} strip_jitter = {} gps_time = None if strip_align: try: strip_offsets = _strip_offsets_for_file(las_file, las) except Exception as e: logger.warning(f" Mesure du calage faisceaux impossible ({e}) — MNT non calé") strip_offsets = {} if strip_offsets: logger.info(" Calage faisceaux : " + ", ".join( f"PSID {p} {off:+.3f} m" for p, off in sorted(strip_offsets.items()))) else: logger.debug(" Calage faisceaux : aucun écart >= " f"{STRIP_ALIGN_THRESHOLD * 100:.1f} cm, rien à corriger") # 2ᵉ passe : gigue intra-faisceau (temps GPS requis, ignorée sinon). try: gps_time = np.asarray(las.gps_time, dtype=np.float64) except AttributeError: gps_time = None if gps_time is not None and len(gps_time) == len(las.points): try: strip_jitter = _strip_jitter_for_file(las_file, las, strip_offsets) except Exception as e: logger.warning(f" Mesure de la gigue intra-faisceau impossible ({e}) — gigue non corrigée") strip_jitter = {} if strip_jitter: for p_, (jt, jc) in sorted(strip_jitter.items()): logger.info(f" Gigue PSID {p_} : ±{np.max(np.abs(jc)) * 100:.1f} cm " f"(rms {np.sqrt(np.mean(np.asarray(jc) ** 2)) * 100:.1f} cm, " f"{len(jt)} fenêtres de {STRIP_JITTER_BIN:g} s)") else: logger.debug(" Gigue intra-faisceau : rien à corriger") try: min_x, max_x = float(las.header.min[0]), float(las.header.max[0]) min_y, max_y = float(las.header.min[1]), float(las.header.max[1]) width = int(np.ceil((max_x - min_x) / resolution)) height = int(np.ceil((max_y - min_y) / resolution)) # Raccord des bords : emprise = dalle nominale 1 km (alignée sur la # grille multi-tuiles) + bande de edge_buffer mètres remplie par les # points sol des voisines. Sinon : bornes de l'en-tête (historique). used_edge_buffer = 0.0 if edge_buffer > 0: coords = _tile_coords(source_laz or las_file) if coords is not None: buffer_px = max(1, int(round(edge_buffer / resolution))) buffer_m = buffer_px * resolution col_km, row_km = coords # Grille LHD : (col, row) = coin nord-ouest en km → # X ∈ [col, col+1] km, Y ∈ [row-1, row] km (bord nord = row). min_x = float(col_km) * 1000.0 max_x = min_x + 1000.0 max_y = float(row_km) * 1000.0 min_y = max_y - 1000.0 ext_bounds = (min_x - buffer_m, min_y - buffer_m, max_x + buffer_m, max_y + buffer_m) width = int(round(1000.0 / resolution)) + 2 * buffer_px height = width min_x, min_y, max_x, max_y = ext_bounds used_edge_buffer = float(edge_buffer) else: logger.warning(" Raccord des bords impossible : nom de " f"fichier non LHD ({basename}) — tuile seule") logger.debug(f" Bounds: X[{min_x:.1f}, {max_x:.1f}] Y[{min_y:.1f}, {max_y:.1f}]") logger.debug(f" Grid: {width}x{height} pixels ({len(las.points):,} points)") logger.info(f" Rasterisation {width}x{height} ({len(las.points):,} points)...") xs = np.asarray(las.x, dtype=np.float64) ys = np.asarray(las.y, dtype=np.float64) zs = np.asarray(las.z, dtype=np.float64) if strip_offsets: lut = np.zeros(65536) for p, off in strip_offsets.items(): lut[int(p) & 0xFFFF] = off zs = zs - lut[np.asarray(las.point_source_id, dtype=np.int64)] if strip_jitter and gps_time is not None: zs = zs - _apply_strip_jitter(las.point_source_id, gps_time, strip_jitter) # Points sol des tuiles voisines dans la bande de raccord (best-effort, # non calés par faisceau : bande de contexte, l'image finale est # recadrée sur la dalle avant livraison). if used_edge_buffer > 0 and source_laz is not None: nx, ny, nz = _neighbor_ground_points( source_laz, (min_x, min_y, max_x, max_y), neighbor_classes if neighbor_classes is not None else [2]) if len(nx): xs = np.concatenate([xs, nx]) ys = np.concatenate([ys, ny]) zs = np.concatenate([zs, nz]) stat = binned_statistic_2d( xs, ys, zs, statistic='mean', bins=[width, height], range=[[min_x, max_x], [min_y, max_y]] ) dtm = stat.statistic.T dtm = dtm[::-1, :] # Flip Y so north is at top # Comblement « historique » (fonctionnement d'origine, rétabli) : # seuls les petits trous proches des données sont remplis ; les grands # trous restent en nodata et apparaissent en noir dans les rendus. # Volontairement PAS de plancher au retour le plus bas : sous canopée # dense ce retour est la végétation, qui imprimerait les arbres dans # le MNT. # Fill small gaps (< 1 m from data) precisely — comme avant nan_count = np.count_nonzero(np.isnan(dtm)) if nan_count > 0: total = dtm.size nan_pct = 100.0 * nan_count / total logger.info(f" {nan_count:,} pixels sans données ({nan_pct:.1f}%)") max_gap_pixels = max(1, int(1.0 / resolution)) from rasterio.fill import fillnodata valid_mask = ~np.isnan(dtm) dtm_filled = fillnodata(dtm, mask=valid_mask, max_search_distance=max_gap_pixels) small_gap_mask = np.isnan(dtm) & ~np.isnan(dtm_filled) filled_count = np.count_nonzero(small_gap_mask) if filled_count > 0: dtm = np.where(small_gap_mask, dtm_filled, dtm) logger.info(f" {filled_count:,} petits trous comblés (< {max_gap_pixels}px)") # Save as GeoTIFF output_tif = dtm_dir / f"{basename}_dtm{output_suffix}.tif" transform = from_bounds(min_x, min_y, max_x, max_y, width, height) with rasterio.open( output_tif, 'w', driver='GTiff', height=height, width=width, count=1, dtype='float32', crs='EPSG:2154', transform=transform, nodata=float('nan'), compress='lzw' ) as dst: dst.write(dtm.astype('float32'), 1) if used_edge_buffer > 0: # Tampon de raccord inscrit dans le fichier : changement de # --edge-buffer ⇒ invalidation automatique du cache DTM. dst.update_tags(**{EDGE_BUFFER_TAG: f"{used_edge_buffer:g}"}) if strip_align: _write_strip_align_sidecar(dtm_dir, basename, output_suffix, strip_offsets, strip_jitter) logger.info(f" ✓ DTM créé: {output_tif.name}") return output_tif except Exception as e: logger.error(f" ✗ Erreur DTM: {e}", exc_info=True) return None