#!/bin/bash # Pipeline LiDAR Archéologique # Utilisation: ./run.sh [options] # # Options: # -r RESOLUTION Résolution en m/px, ou multiples séparées par virgules (défaut: 0.5, ex: 0.5,0.2) # -w WORKERS Nombre de workers parallèles (défaut: 1) # -g [LISTE] Sélectionner le(s) GPU(s) : -g (auto), -g 0, -g 0,2, -g all # -v Mode verbeux # --debug Mode debug # -f / --force Régénérer tous les fichiers # --keep-tif Conserver les fichiers TIFF # --force-classification # --ground-classification {auto,smrf,csf} # --quality N Qualité image 1-100 (défaut: 98) # --lossless Compression lossless # --format FMT Format de sortie : avif (défaut) ou webp # --only VIZ... Générer uniquement ces visualisations # --skip VIZ... Exclure ces visualisations # --file NOM... Traiter un ou plusieurs fichiers LAZ # --test Exécuter les tests unitaires # -h Afficher l'aide complète set -e SCRIPT_DIR="$(cd "$(dirname "$0")" && pwd)" INPUT_DIR="${SCRIPT_DIR}/input" OUTPUT_DIR="${SCRIPT_DIR}/output" IMAGE_NAME="lidar-lidar" # Afficher l'aide si aucun argument if [ $# -eq 0 ]; then echo "Pipeline LiDAR Archéologique" echo "" echo "Usage: $0 [options]" echo "" echo "Options:" echo " -r RESOLUTION Résolution en m/px, ou multiples (défaut: 0.5, ex: 0.5,0.2)" echo " -w WORKERS Nombre de workers CPU parallèles (défaut: 1)" echo " -g [LISTE] Sélectionner le(s) GPU(s) : -g (auto), -g 0, -g 0,2, -g all" echo " -v Mode verbeux (timestamps + niveaux)" echo " --debug Mode debug (détails internes fichier:ligne)" echo " -f / --force Régénérer tous les fichiers même si les AVIF existent" echo " --force-classification" echo " Reclassifier le sol même si le fichier .las existe" echo " --keep-tif Conserver les TIFF pour régénérer les AVIF" echo " --ground-classification {auto,smrf,csf}" echo " Méthode de classification du sol (défaut: auto)" echo " --quality N Qualité image 1-100 (défaut: 98, 100=lossless)" echo " --lossless Compression lossless (équivalent à --quality 100)" echo " --format FMT Format de sortie : avif (défaut) ou webp" echo " --only VIZ... Générer uniquement ces visualisations" echo " --skip VIZ... Exclure ces visualisations" echo " --file NOM... Traiter un ou plusieurs fichiers LAZ (nom complet sans .laz/.las)" echo " --test Exécuter les tests unitaires" echo " -h Afficher cette aide" echo "" echo "Visualisations disponibles:" echo " hillshade slope mslrm sailore pos_open neg_open" echo " svf aniso_open roughness wavelet flow_acc" echo " ortho topo" echo "" echo "Exemples:" echo " $0 -g # GPU auto (premier disponible)" echo " $0 -g 0 # GPU index 0" echo " $0 -g 0,2 # GPUs 0 et 2" echo " $0 -g all # Tous les GPUs" echo " $0 -g -w 4 # GPU + 4 workers" echo " $0 -g -r 0.2 # Haute résolution" echo " $0 -g -r 0.5,0.2 # Multi-résolution (0.5m + 0.2m)" echo " $0 -g --force # Régénérer AVIF (DTM conservé si --keep-tif)" echo " $0 -g --force-classification # Reclassifier le sol seulement" echo " $0 -g --ground-classification csf # Forcer CSF (terrain complexe)" echo " $0 -g --file LHD_...IGN69.copc # Un fichier" exit 0 fi RESOLUTION=0.5 WORKERS=1 GPU_FLAG="" GPU_ARG="" VERBOSE_FLAG="" FORCE_FLAG="" FILE_ARGS="" GROUND_METHOD="" FORCE_CLASSIFY_FLAG="" KEEP_TIF_FLAG="" QUALITY="" FORMAT_FLAG="" ONLY_FLAG="" SKIP_FLAG="" TEST_FLAG=0 # Parse arguments manually (more robust than getopts for mixed short/long options) while [ $# -gt 0 ]; do case "$1" in -r) RESOLUTION="$2"; shift 2 ;; -w) WORKERS="$2"; shift 2 ;; -g) GPU_FLAG="--gpus all" # Check if next arg is a GPU selector (not another flag) if [ $# -gt 1 ] && [[ ! "$2" =~ ^- ]] && [[ "$2" != "all" || "$2" == "all" ]]; then GPU_ARG="$2" GPU_FLAG="--gpus all" shift 2 else shift fi ;; -v) VERBOSE_FLAG="-v"; shift ;; -f) FORCE_FLAG="--force"; shift ;; --debug) VERBOSE_FLAG="--debug"; shift ;; --force) FORCE_FLAG="--force"; shift ;; --force-classification) FORCE_CLASSIFY_FLAG="--force-classification"; shift ;; --keep-tif) KEEP_TIF_FLAG="--keep-tif"; shift ;; --ground-classification) GROUND_METHOD="$2"; shift 2 ;; --ground-classification=*) GROUND_METHOD="${1#--ground-classification=}"; shift ;; --quality) QUALITY="--quality $2"; shift 2 ;; --lossless) QUALITY="--lossless"; shift ;; --format) FORMAT_FLAG="--format $2"; shift 2 ;; --only) shift; ONLY_FLAG="--only"; while [ $# -gt 0 ] && [[ ! "$1" =~ ^- ]]; do ONLY_FLAG="$ONLY_FLAG $1"; shift; done ;; --skip) shift; SKIP_FLAG="--skip"; while [ $# -gt 0 ] && [[ ! "$1" =~ ^- ]]; do SKIP_FLAG="$SKIP_FLAG $1"; shift; done ;; --file) shift; while [ $# -gt 0 ] && [[ ! "$1" =~ ^- ]]; do FILE_ARGS="$FILE_ARGS $1"; shift; done ;; --test) TEST_FLAG=1 ;; -h|--help|-help) echo "Pipeline LiDAR Archéologique" echo "" echo "Usage: $0 [options]" echo "" echo "Options:" echo " -r RESOLUTION Résolution en m/px (défaut: 0.5)" echo " -w WORKERS Nombre de workers CPU parallèles (défaut: 1)" echo " -g [LISTE] Sélectionner le(s) GPU(s) : -g (auto), -g 0, -g 0,2, -g all" echo " -v Mode verbeux (timestamps + niveaux)" echo " --debug Mode debug (détails internes fichier:ligne)" echo " -f / --force Régénérer tous les fichiers même si les AVIF existent" echo " --force-classification" echo " Reclassifier le sol même si le fichier .las existe" echo " --keep-tif Conserver les TIFF pour régénérer les AVIF" echo " --ground-classification {auto,smrf,csf}" echo " Méthode de classification du sol (défaut: auto)" echo " --quality N Qualité image 1-100 (défaut: 98, 100=lossless)" echo " --lossless Compression lossless (équivalent à --quality 100)" echo " --format FMT Format de sortie : avif (défaut) ou webp" echo " --only VIZ... Générer uniquement ces visualisations" echo " --skip VIZ... Exclure ces visualisations" echo " --file NOM... Traiter un ou plusieurs fichiers LAZ" echo " --test Exécuter les tests unitaires" echo " -h Afficher cette aide" echo "" echo "Visualisations disponibles:" echo " hillshade slope mslrm sailore pos_open neg_open" echo " svf aniso_open roughness wavelet flow_acc" echo " ortho topo" echo "" echo "Exemples:" echo " $0 -g # GPU auto (premier disponible)" echo " $0 -g 0 # GPU index 0" echo " $0 -g 0,2 # GPUs 0 et 2" echo " $0 -g all # Tous les GPUs" echo " $0 -g -w 4 # GPU + 4 workers" echo " $0 -g -v # GPU + verbeux" echo " $0 -g -r 0.2 # Haute résolution" echo " $0 -g -r 0.5,0.2 # Multi-résolution (0.5m + 0.2m)" echo " $0 -g --force # Régénérer AVIF" echo " $0 -g --only hillshade svf # Seulement 2 visualisations" echo " $0 -g --skip ortho topo # Sans les overlays IGN" echo " $0 -g --lossless # AVIF lossless" echo " $0 -g --quality 90 # AVIF qualité 90" echo " $0 -g --ground-classification csf # Forcer CSF (terrain complexe)" echo " $0 -g --file LHD_...IGN69.copc # Un fichier" exit 0 ;; *) echo "Option invalide: $1" >&2; exit 1 ;; esac done # Trim FILE_ARGS whitespace FILE_ARGS=$(echo "$FILE_ARGS" | xargs) # Check for --test flag first if [ "$TEST_FLAG" -eq 1 ]; then # Build l'image si elle n'existe pas if ! docker image inspect "$IMAGE_NAME" >/dev/null 2>&1; then echo "Build de l'image Docker..." docker build -t "$IMAGE_NAME" "$SCRIPT_DIR" fi echo "============================================" echo " Tests unitaires LiDAR Pipeline" echo "============================================" docker run --rm --init $GPU_FLAG \ "$IMAGE_NAME" \ python3 -m pytest -v --pyargs lidar_pipeline.tests exit $? fi # Build l'image si elle n'existe pas if ! docker image inspect "$IMAGE_NAME" >/dev/null 2>&1; then echo "Build de l'image Docker..." docker build -t "$IMAGE_NAME" "$SCRIPT_DIR" fi # Créer les répertoires s'ils n'existent pas mkdir -p "$INPUT_DIR" "$OUTPUT_DIR" # Lancer le pipeline echo "============================================" echo " Pipeline LiDAR Archéologique" echo "============================================" echo " Résolution : ${RESOLUTION}m/px" echo " Workers : ${WORKERS}" echo " GPU : $([ -n "$GPU_FLAG" ] && echo "OUI${GPU_ARG:+ ($GPU_ARG)}" || echo 'non')" echo " Verbeux : $([ -n "$VERBOSE_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')" echo " Force : $([ -n "$FORCE_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')" echo " Force classif.: $([ -n "$FORCE_CLASSIFY_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')" echo " Keep TIFF : $([ -n "$KEEP_TIF_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')" echo " Qualité image : $([ -n "$QUALITY" ] && echo "$QUALITY" || echo '98')" echo " Format : $([ -n "$FORMAT_FLAG" ] && echo "${FORMAT_FLAG#--format }" || echo 'avif')" echo " Classification sol : $([ -n "$GROUND_METHOD" ] && echo "$GROUND_METHOD" || echo 'auto')" if [ -n "$ONLY_FLAG" ]; then echo " Visualisations: uniquement${ONLY_FLAG#--only}" elif [ -n "$SKIP_FLAG" ]; then echo " Visualisations: tout sauf${SKIP_FLAG#--skip}" fi if [ -n "$FILE_ARGS" ]; then echo " Fichiers :${FILE_ARGS}" fi echo "============================================" CMD_ARGS="-o /data/output -r $RESOLUTION -w $WORKERS $VERBOSE_FLAG $FORCE_FLAG $FORCE_CLASSIFY_FLAG $KEEP_TIF_FLAG $QUALITY $FORMAT_FLAG" if [ -n "$GPU_ARG" ]; then CMD_ARGS="$CMD_ARGS -g $GPU_ARG" fi if [ -z "$GPU_ARG" ] && [ -n "$GPU_FLAG" ]; then CMD_ARGS="$CMD_ARGS -g" fi if [ -n "$GROUND_METHOD" ]; then CMD_ARGS="$CMD_ARGS --ground-classification $GROUND_METHOD" fi if [ -n "$ONLY_FLAG" ]; then CMD_ARGS="$CMD_ARGS $ONLY_FLAG" fi if [ -n "$SKIP_FLAG" ]; then CMD_ARGS="$CMD_ARGS $SKIP_FLAG" fi if [ -n "$FILE_ARGS" ]; then CMD_ARGS="$CMD_ARGS --file $FILE_ARGS" fi docker run --rm --init $GPU_FLAG \ --user 1000:1000 \ -v "${INPUT_DIR}:/data/input:ro" \ -v "${OUTPUT_DIR}:/data/output" \ "$IMAGE_NAME" \ python3 -m lidar_pipeline /data/input \ $CMD_ARGS