- Ajout classification automatique du sol (SMRF/PMF/CSF) avec détection
heuristique (ratio retours uniques > 0.6 → PMF urbain, sinon SMRF)
- Pré-traitement PDAL recommandé avant classification: ELM + outlier
removal (cell=5.0, threshold=2.0 adapté au calcaire rocailleux)
- Options CLI: --ground-classification {auto,smrf,pmf,csf} et
--force-classification pour forcer la reclassification
- Fix double logging (logger.propagate = False)
- Fix --force non transmis dans run.sh (réécriture parsing arguments)
- Fix warning numpy 'partition will ignore mask': conversion MaskedArray
en ndarray avant np.percentile()
- Ajout liblaszip8 + lazrs pour support LAZ dans Docker et laspy
- Tests unitaires pour PMF, CSF et auto-détection
Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>
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7.7 KiB
Bash
Executable File
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Bash
Executable File
#!/bin/bash
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# Pipeline LiDAR Archéologique
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# Utilisation: ./run.sh [options]
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#
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# Options:
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# -r RESOLUTION Résolution en m/px (défaut: 0.5)
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# -w WORKERS Nombre de workers parallèles (défaut: 1)
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# -g Activer l'accélération GPU
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# -v Mode verbeux (timestamps + niveaux)
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# --debug Mode debug (détails internes fichier:ligne)
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# -f / --force Régénérer tous les fichiers même si existants
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# --force-classification
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# Reclassifier le sol même si le fichier .las existe déjà
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# --ground-classification {auto,smrf,pmf,csf}
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# Méthode de classification du sol (défaut: auto)
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# --file NOM... Traiter un ou plusieurs fichiers LAZ spécifiques
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# --test Exécuter les tests unitaires
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# -h Afficher l'aide complète
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set -e
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# Afficher l'aide si aucun argument
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if [ $# -eq 0 ]; then
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echo "Pipeline LiDAR Archéologique"
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echo ""
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echo "Usage: $0 [options]"
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echo ""
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echo " -r RESOLUTION Résolution en m/px (défaut: 0.5)"
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echo " -w WORKERS Nombre de workers CPU parallèles (défaut: 1)"
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echo " -g Activer l'accélération GPU NVIDIA"
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echo " -v Mode verbeux (timestamps + niveaux)"
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echo " --debug Mode debug (détails internes fichier:ligne)"
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echo " -f / --force Régénérer tous les fichiers même si les WebP existent"
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echo " --force-classification"
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echo " Reclassifier le sol même si le fichier .las existe"
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echo " --ground-classification {auto,smrf,pmf,csf}"
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echo " Méthode de classification du sol (défaut: auto)"
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echo " --file NOM... Traiter un ou plusieurs fichiers LAZ (nom complet sans .laz/.las)"
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echo " --test Exécuter les tests unitaires"
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|
echo " -h Afficher cette aide"
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echo ""
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|
echo "Exemples:"
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echo " $0 -g # GPU, auto"
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echo " $0 -g -w 4 # GPU + 4 workers"
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echo " $0 -g -v # GPU + verbeux"
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echo " $0 -g -r 0.2 # Haute résolution"
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echo " $0 -g --force # Tout régénérer (WebP + classification)"
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echo " $0 -g --force-classification # Reclassifier le sol seulement"
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echo " $0 -g --ground-classification pmf # Forcer PMF"
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echo " $0 -g --file LHD_...IGN69.copc # Un fichier"
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echo " $0 -g --file LHD_...6881.copc LHD_...6882.copc"
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exit 0
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fi
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SCRIPT_DIR="$(cd "$(dirname "$0")" && pwd)"
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INPUT_DIR="${SCRIPT_DIR}/input"
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OUTPUT_DIR="${SCRIPT_DIR}/output"
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IMAGE_NAME="lidar-lidar"
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RESOLUTION=0.5
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WORKERS=1
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GPU_FLAG=""
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VERBOSE_FLAG=""
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FORCE_FLAG=""
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FILE_ARGS=""
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GROUND_METHOD=""
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FORCE_CLASSIFY_FLAG=""
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# Parse arguments manually (more robust than getopts for mixed short/long options)
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while [ $# -gt 0 ]; do
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case "$1" in
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-r) RESOLUTION="$2"; shift 2 ;;
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-w) WORKERS="$2"; shift 2 ;;
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-g) GPU_FLAG="--gpus all"; shift ;;
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-v) VERBOSE_FLAG="-v"; shift ;;
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-f) FORCE_FLAG="--force"; shift ;;
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--debug) VERBOSE_FLAG="--debug"; shift ;;
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--force) FORCE_FLAG="--force"; shift ;;
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--force-classification) FORCE_CLASSIFY_FLAG="--force-classification"; shift ;;
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--ground-classification) GROUND_METHOD="$2"; shift 2 ;;
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--ground-classification=*) GROUND_METHOD="${1#--ground-classification=}"; shift ;;
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--file) shift; while [ $# -gt 0 ] && [[ ! "$1" =~ ^- ]]; do FILE_ARGS="$FILE_ARGS $1"; shift; done ;;
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--test) ;; # Handled below
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-h|--help|-help)
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echo "Pipeline LiDAR Archéologique"
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echo ""
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echo "Usage: $0 [options]"
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echo ""
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echo " -r RESOLUTION Résolution en m/px (défaut: 0.5)"
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echo " -w WORKERS Nombre de workers CPU parallèles (défaut: 1)"
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|
echo " -g Activer l'accélération GPU NVIDIA"
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|
echo " -v Mode verbeux (timestamps + niveaux)"
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|
echo " --debug Mode debug (détails internes fichier:ligne)"
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|
echo " -f / --force Régénérer tous les fichiers même si les WebP existent"
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|
echo " --force-classification"
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|
echo " Reclassifier le sol même si le fichier .las existe"
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|
echo " --ground-classification {auto,smrf,pmf,csf}"
|
|
echo " Méthode de classification du sol (défaut: auto)"
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|
echo " --file NOM... Traiter un ou plusieurs fichiers LAZ (nom complet sans .laz/.las)"
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|
echo " --test Exécuter les tests unitaires"
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|
echo " -h Afficher cette aide"
|
|
echo ""
|
|
echo "Exemples:"
|
|
echo " $0 -g # GPU, auto"
|
|
echo " $0 -g -w 4 # GPU + 4 workers"
|
|
echo " $0 -g -v # GPU + verbeux"
|
|
echo " $0 -g -r 0.2 # Haute résolution"
|
|
echo " $0 -g --force # Tout régénérer (WebP + classification)"
|
|
echo " $0 -g --force-classification # Reclassifier le sol seulement"
|
|
echo " $0 -g --ground-classification pmf # Forcer PMF"
|
|
echo " $0 -g --file LHD_...IGN69.copc # Un fichier"
|
|
echo " $0 -g --file LHD_...6881.copc LHD_...6882.copc"
|
|
exit 0
|
|
;;
|
|
*) echo "Option invalide: $1" >&2; exit 1 ;;
|
|
esac
|
|
done
|
|
|
|
# Trim FILE_ARGS whitespace
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|
FILE_ARGS=$(echo "$FILE_ARGS" | xargs)
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|
# Check for --test flag first
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if [[ " $* " == *" --test "* ]]; then
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|
# Build l'image si elle n'existe pas
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|
if ! docker image inspect "$IMAGE_NAME" >/dev/null 2>&1; then
|
|
echo "Build de l'image Docker..."
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|
docker build -t "$IMAGE_NAME" "$SCRIPT_DIR"
|
|
fi
|
|
echo "============================================"
|
|
echo " Tests unitaires LiDAR Pipeline"
|
|
echo "============================================"
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|
docker run --rm $GPU_FLAG \
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|
"$IMAGE_NAME" \
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|
python3 -m pytest -v --pyargs lidar_pipeline.tests
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|
exit $?
|
|
fi
|
|
|
|
# Build l'image si elle n'existe pas
|
|
if ! docker image inspect "$IMAGE_NAME" >/dev/null 2>&1; then
|
|
echo "Build de l'image Docker..."
|
|
docker build -t "$IMAGE_NAME" "$SCRIPT_DIR"
|
|
fi
|
|
|
|
# Créer les répertoires s'ils n'existent pas
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mkdir -p "$INPUT_DIR" "$OUTPUT_DIR"
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# Lancer le pipeline
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echo "============================================"
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echo " Pipeline LiDAR Archéologique"
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echo "============================================"
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echo " Résolution : ${RESOLUTION}m/px"
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echo " Workers : ${WORKERS}"
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echo " GPU : $([ -n "$GPU_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')"
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echo " Verbeux : $([ -n "$VERBOSE_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')"
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echo " Force : $([ -n "$FORCE_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')"
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echo " Force classif.: $([ -n "$FORCE_CLASSIFY_FLAG" ] && echo 'OUI' || echo 'non')"
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|
echo " Classification sol : $([ -n "$GROUND_METHOD" ] && echo "$GROUND_METHOD" || echo 'auto')"
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|
if [ -n "$FILE_ARGS" ]; then
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|
echo " Fichiers :${FILE_ARGS}"
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|
fi
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|
echo "============================================"
|
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|
CMD_ARGS="-o /data/output -r $RESOLUTION -w $WORKERS $VERBOSE_FLAG $FORCE_FLAG $FORCE_CLASSIFY_FLAG"
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|
if [ -n "$GROUND_METHOD" ]; then
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|
CMD_ARGS="$CMD_ARGS --ground-classification $GROUND_METHOD"
|
|
fi
|
|
if [ -n "$FILE_ARGS" ]; then
|
|
CMD_ARGS="$CMD_ARGS --file $FILE_ARGS"
|
|
fi
|
|
|
|
docker run --rm $GPU_FLAG \
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--user 1000:1000 \
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-v "${INPUT_DIR}:/data/input:ro" \
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|
-v "${OUTPUT_DIR}:/data/output" \
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|
"$IMAGE_NAME" \
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|
python3 -m lidar_pipeline /data/input \
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$CMD_ARGS |